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PCR擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)輕松上手:圖解詳解步驟,助您快速掌握

發(fā)布時(shí)間:2024-03-26     發(fā)布作者:通蔚生物

  聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng) (PCR) 有時(shí)稱(chēng)為分子復(fù)印,傳統(tǒng)的聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng) (PCR) 有時(shí)稱(chēng)為分子復(fù)印,是一種用于放大(復(fù)制)樣品中痕量 DNA RNA 的技術(shù)。PCR 熱循環(huán)儀用于生產(chǎn)研究所需的大量樣品。


  PCR 過(guò)程可用于多種實(shí)驗(yàn)室和臨床應(yīng)用和目的。法醫(yī)實(shí)驗(yàn)室用它來(lái)分析犯罪現(xiàn)場(chǎng)的 DNA 樣本。臨床醫(yī)療保健實(shí)驗(yàn)室用它來(lái)診斷病毒感染的患者。制藥研究實(shí)驗(yàn)室使用它來(lái)分析和復(fù)制 DNA RNA 樣本,用于藥物和疫苗的制造。


  PCR原理


  在PCR實(shí)驗(yàn)過(guò)程,需要四種成分(試劑或化學(xué)品)如下:


  DNA RNA 樣本(來(lái)自唾液、血液、頭發(fā)、皮膚刮屑等)


  (1)、DNA 引物:促進(jìn)核苷酸互補(bǔ)鏈合成的短單鏈 DNA


   (2)、DNA聚合酶:一種有助于合成DNA互補(bǔ)鏈的酶


  (3)、含有腺嘌呤 (A)、胸苷 (T)、胞嘧啶 (C) 和鳥(niǎo)嘌呤 (G) 的核苷酸溶液混合物,用于構(gòu)建重復(fù)的 DNA


  原理分為四步走,如下:


  (1)變性:是利用DNA在體外高溫時(shí)變性,雙鏈解離變成單鏈;


  (2)退火:低溫時(shí)引物與單鏈DNA按堿基互補(bǔ)配對(duì)原則結(jié)合;


  (3)延伸:再調(diào)溫度至DNA聚合酶最適反應(yīng)溫度(72℃左右),DNA聚合酶沿著磷酸到五碳糖(5- 3)的方向合成互補(bǔ)鏈。


  將這3個(gè)步驟重復(fù)(“循環(huán)”)25-35次,即可按指數(shù)方式獲得精確的目標(biāo)DNA拷貝。


  PCR原理是一種用于放大擴(kuò)增特定的DNA片段的分子生物學(xué)技術(shù)。以單鏈DNA為模板,4dNTP為底物原料,在引物引導(dǎo)的情況下,模板與底物通過(guò)DNA聚合酶的聚合延伸,多次重復(fù)后使DNA呈指數(shù)擴(kuò)增復(fù)制。


PCR原理圖


  PCR流程步驟


  PCR過(guò)程有 4 個(gè)步驟:收集、制備、擴(kuò)增和 PCR 后清理。PCR 機(jī)器步驟發(fā)生在擴(kuò)增步驟中。首先將一段 DNA 樣本與上面列出的試劑和化學(xué)品一起放入合適的試管中。將管放入PCR 機(jī)或熱循環(huán)儀中。熱循環(huán)儀通過(guò) 3 個(gè)步驟處理溶液:變性、退火和延伸。


PCR步驟圖



  PCR擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)步驟


  第 1 - 變性


  使用熱循環(huán)儀將管中包含的溶液加熱至至少 94°C (201.2°F)。熱量會(huì)破壞原始 DNA 樣品的氫鍵,并將 DNA 分離成單鏈(這稱(chēng)為雙鏈 DNA 變性)。


  第 2 - 退火


  然后將樣品混合物冷卻至 50 60°C122 140°F),使 DNA 引物和 DNA 聚合酶與通過(guò)加熱分離的各個(gè) DNA 鏈結(jié)合(這稱(chēng)為 DNA 退火)引物)。此時(shí),添加的混合物溶液中的核苷酸(A、T、C、G)將與加熱過(guò)程中產(chǎn)生的單獨(dú)的 DNA 鏈配對(duì)。


  第 3 - 擴(kuò)展


  一旦連接在一起,它們就會(huì)形成一條新的互補(bǔ) DNA 鏈(稱(chēng)為 DNA 延伸)。因此,由原始樣品分子的每條單鏈形成了新的雙鏈DNA分子副本。溫度從 95°C 循環(huán)至 50 60°C。然后使用熱循環(huán)器重復(fù)該循環(huán)約 35 40 次,熱循環(huán)器自動(dòng)重復(fù)該過(guò)程的加熱和冷卻循環(huán)。每次循環(huán)儀進(jìn)行加熱/冷卻循環(huán)時(shí),所得 DNA 序列都會(huì)加倍。因此,最初來(lái)自一個(gè)樣本的一小段 DNA 35 個(gè)倍增循環(huán)后可以被擴(kuò)增形成數(shù)百萬(wàn)個(gè)拷貝。


PCR 流程循環(huán)

  PCR 三個(gè)主要步驟的流程圖,包括 PCR 溫度循環(huán)、循環(huán)次數(shù)和總程序長(zhǎng)度


  該過(guò)程提供了由原始樣品分子的每條單鏈形成的新的雙鏈DNA分子副本。這個(gè)三步過(guò)程需要進(jìn)行 35 40 次,才能將 DNA/RNA 擴(kuò)增成數(shù)百萬(wàn)個(gè)重復(fù)片段。


  第 4 - 電泳分析


  一旦 PCR 過(guò)程完成,所產(chǎn)生的擴(kuò)增(復(fù)制)片段就可以與已知來(lái)源的其他核苷酸片段進(jìn)行比較。然后將 PCR 生成的核苷酸序列放置在分離凝膠中的人類(lèi)、病原體或其他來(lái)源的已知核苷酸序列旁邊。然后電流通過(guò)凝膠,凝膠內(nèi)的各種核苷酸序列根據(jù)其電荷和分子大小形成類(lèi)似梯子的帶。這稱(chēng)為凝膠電泳。在凝膠中遷移到相同水平的條帶或梯狀臺(tái)階顯示了核苷酸序列的同一性。這種方法是完成 PCR 測(cè)試最流行的方法之一。


  定量PCR


  qPCR 是傳統(tǒng) PCR 的一種變體,允許在通常的 40 個(gè)循環(huán)過(guò)程中使用熒光染料實(shí)時(shí)分析擴(kuò)增/復(fù)制的 DNA。熒光染料附著在一些核苷酸鏈上,允許用戶(hù)在擴(kuò)增/復(fù)制循環(huán)期間測(cè)量特定產(chǎn)物及其數(shù)量。qPCR 使用特殊的熱循環(huán)儀,稱(chēng)為實(shí)時(shí)熱循環(huán)儀。除了加熱和冷卻裝有 PCR 試劑的管子外,他們還可以在每個(gè)循環(huán)中測(cè)量管內(nèi)的熒光。這使得用戶(hù)可以跳過(guò) PCR 產(chǎn)物最終分析所需的凝膠電泳或其他輔助程序,從而更快地產(chǎn)生結(jié)果。